Kompetensi Keahlian Teknika Kapal Niaga SMK Negeri 9 Pontianak merupakan program kejuruan yang melaksanakan Standar Operasional Prosedur Manajemen Mutu Internasional ISO 9001:2015 yang disahkan Delta Pas Internasional. Tujuan Kompetensi Keahlian Teknika Kapal Niaga yaitu membentuk lulusan yang berkompeten untuk menghasilkan perwira bagian mesin yang mampu mendemonstrasikan kompetensi untuk menerima tugas – tugas, kewajiban dan tanggung jawab pada tingkat operasional di kapal niaga dengan kemampuan mental, moral dan kesemaptaan serta kepemimpinan yang kuat bertindak sebagai pemimpin di kapal pada bagian mesin. Tenaga Ahli Teknika sangat dibutuhkan oleh perusahaan pelayaran nasional maupun internasional serta industri maritim lainnya dengan penghasilan yang menarik.
Program Keahlian Teknika Kapal Niaga bernaung dalam dua Kementerian yaitu Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan dan Kementerian Perhubungan. Kurikulum yang diterapkan berdasarkan sinkronisasi antara Kurikulum 2013 dan IMO Model Course 7.04. Mata Pelajaran Kejuruan Teknika Kapal Niaga berdasarkan sinkronisasi kurikulum tersebut yaitu :
- Prosedur Darurat dan SAR (Emergency Procedure and SAR)
- Hukum Maritim (Maritime Law)
- Pencegahan Pencemaran Lingkungan Laut (Marine Pollution of Prevention include Environment Awareness)
- Bahasa Inggris Maritim (Maritime English)
- Konstruksi dan Stabilitas Kapal (Ship Construction and Stability)
- Dinas Jaga Mesin dan Kepedulian Keamanan (Watch Keeping and Security Awareness)
- Mesin Penggerak Utama (Main Propulsion Engine)
- Permesinan Bantu (Auxiliary Machinery)
- Sistem Kelistrikan Kapal (Marine Electrical System)
- Elektronika (Electronics)
- Sistem Kontrol (Control System)
- Ilmu Bahan (Fabrication and Repair Material)
- Perbengkelan (Use of Hand and Powertools)
- Perawatan dan Perbaikan Permesinan Kapal (Marine Engineering Maintenance and Repair)
- Desain dan Gambar Permesinan Kapal (Marine Engineering Drawing and Design)
- Thermodinamika